Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF6Q330K2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms