Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HFEQ30201 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HFEQ30201 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms