Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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