Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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