Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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