Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HADHQ16836 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms