Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RPE65Q16518 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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