Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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