Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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