Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms