Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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