Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms