Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms