Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms