Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SPIDRQ14159 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SPIDRQ14159 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SPIDRQ14159 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SPIDRQ14159 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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