Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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