Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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