Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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