Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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