Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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