Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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