Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGB3BPQ13352 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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