Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms