Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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NR1H3Q13133 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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