Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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