Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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