Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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