Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXO1Q12778 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXO1Q12778 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXO1Q12778 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXO1Q12778 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXO1Q12778 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXO1Q12778 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXO1Q12778 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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