Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms