Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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