Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms