Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms