Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms