Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms