Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms