Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED6P86452 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms