Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAE1P78406 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms