Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFM1P61960 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFM1P61960 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFM1P61960 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFM1P61960 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms