Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms