Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LOXL3P58215 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL3P58215 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms