Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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