Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms