Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERFP50548 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERFP50548 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms