Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CRIP1P50238 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CRIP1P50238 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms