Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms