Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT3P49368 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT3P49368 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms