Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA4P48169 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms