Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR4A2P43354 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms