Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAEP38570 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms