Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms